漆黑的夜晚，一名间谍悄然潜入日本警方某机构，盗走了记载着各国谍报机构重要数据的绝密文件的绝密数据。日本警方和FBI探员赤井秀一（池田秀一 配音）旋即与间谍展开追逐。最后，逃亡者的车辆坠落悬崖。第二天，柯南（高山南 配音）和伙伴们来到东都水族馆观光，结果发现一名受伤的美丽女子（天海佑希 配音）。该女子处于失忆状态，身上的手机也破损无法使用。柯南等人答应要帮她恢复记忆，当他们七嘴八舌之际，藏在暗处的黑衣组织成员贝尔摩德（小山茉美 配音）冷冷地注视着这一切。在相处过程中，女子非凡的身手和奇怪的言行举止让灰原哀（林原惠美 配音）对其真实身份产生怀疑。 刚刚还一派祥和的水族馆，沉浸在快乐之中的人们，根本会想到随着那名神秘女子技艺的恢复，自己马上就要被卷入黑暗组织的杀戮和混乱之中……
宫野真守 岛崎信长 高桥李依 坂本真绫 川澄绫子 水岛大宙 泽城美雪 置鲇龙太郎 内山昂辉 安元洋贵 子安武人 田中美海 小松未可子 鹤冈聪 稻田彻 千本木彩花 铃村健一 中田让治 樱井孝宏
藤原启治 种田梨沙 加隈亚衣 水濑祈 利根健太朗 原由实 山本希望 樱井孝宏 杉山大 米泽圆 拜真之介 村瀬步 田中敦子 赤崎千夏 早见沙织 大川透 中西敏治 泽城美雪 钉宫理惠 佐仓绫音 矢作纱友里 木村雅史 内田夕夜 置鲇龙太郎 乃村健次 菊池幸利 志贺麻登佳 小松史法 下山吉光 江口拓也 久野美咲 三宅麻理惠 最上嗣生 浪川大辅 小山刚志
高桥李依 内山夕实 小林裕介 水濑祈 村川梨衣 子安武人 玄田哲章 日野聪 绵贯龙之介 相马康一 杉崎亮 铃木毬花 丸山智行 长谷川育美 森千早都 赤尾光 手冢弘道 石井隆之 岩泽俊树 铃木崚汰 村上裕哉
渊上舞 茅野爱衣 尾崎真实 中上育实 井口裕香 福圆美里 高桥美佳子 植田佳奈 菊地美香 吉冈麻耶 桐村麻里 中村樱 仙台惠理 森谷里美 井上优佳 大桥步夕 竹内仁美 中里望 多田好 山冈百合 秋奈 井泽诗织 山本希望 石原舞 金元寿子 喜多村英梨 叶山郁美 仓田雅世 上坂堇 佐仓绫音 高森奈津美 大地叶 米泽圆 七濑亚深 原由实 津田美波 安济知佳 明坂聪美 川澄绫子 伊濑茉莉也 平野绫 田中理惠 生天目仁美 早见沙织 濑户麻沙美 能登麻美子 下地紫野 饭田友子 椎名碧流
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